[MYSQL] Confronto tra due tabelle diverse

[Francescoq]

Salve ho due tabelle e ogni sera devo importare i dati di una tabella nell'altra la cosa prende diverse ore e vorrei velocizzarla imposrtando solo i dati che sono variati.
si tratta di un file csv di un gestionale che va importato in un mysql di un ecommerce
in un unica direzione il gestionale aggiorna l'ecommerce e basta.
tabella gestionale i campi importanti sono
codiceProdotto | giacenza

tabella e-commerce
codiceProdotto | giacenza

ora saltando tutta la parte di letturafile importazione con creazione tabella del csv ecc.
la cosa che devo fare è evitare la ricerca sequenziale record per record vorrei quindi
1) aggiornare solo i prodotti che tra per stesso codice prodotto hanno giacenza differente
2) importare i nuovi prodotti presenti nel gesionale e non nell e-commerce
attualmente faccio questa cosa prodotto per prodotto e ci vogliono 3 ore per 29.000 prodotti
quindi aggiornando solo chi ha giacenza diversa dovrei risolvere ma come?

[optime]

prima vediamo se riusciamo a selezionarli

SELECT 
   T1.Codice, T1.Giacenza, T2.Codice, T2.Giacenza 
FROM 
   TABELLA1 T1 JOIN TABELLA2 T2 
   ON T1.Codice=T2.Codice AND T1.Giacenza<>T2.Giacenza

Facce sape'