[C++]Conversione da RNA a proteine

[DarkKnightPro]

Salve a tutti, sto eseguendo un programma per la trasformazione da sequenza di basi dell'RNA, quindi per esempio da CUAAUC a CUA e AUC, negli amminoacidi corrispondenti, tutto ciò salvato su un file di testo strutturato in questo modo:
UUU=Fenilallanina
GGG=blabla
...ecc
Ho deciso di strutturarlo in questo modo, un for che ha il compito di eseguirsi tot volte per spezzettare la sequenza in stringhe da 3 caratteri usate come variabile per la sua ricerca nel file di testo. Tuttavia ho un problema, anzichè stampare solo per esempio UUU=Fenilallanina, stampa tutto il file di testo, potreste aiutarmi?
Riporto il codice qui di seguito...

#include <iostream>
#include <fstream>
using namespace std;
main(void)
{
    string line;
    string letters,BASE;
    ifstream readSearch;
    ifstream FileSearch;
    cout<<"enter search word ";
             cin>>letters;
             int j=0;
             for(int i=0;i<letters.length()/3;i++){
             letters.substr(j,3)=BASE;
             FileSearch.open("Corr Cod-Amm.txt");
            if(FileSearch.is_open())
            {
    
            while (getline(FileSearch, line)) {
            if (line.find(BASE)!=string::npos) {
            cout << line << endl;
            }
            }
            cout << BASE << " not found" << endl;
            }
             j=j+3;
            }
             "\n";
    
}

[oregon]

Ma questa

letters.substr(j,3)=BASE;

forse volevi scriverla così

BASE=letters.substr(j,3);

e poi la riga

"\n";

non ha alcun senso...

P.S. Usa i tag CODE per il codice!