Quale charset?

[Teuzzo]

Ho installato un server Fedora con php 4.3.10 e Mysql 4.0.
Ho importato da un server windows i db e i file per il web.
Il problema è il seguente:
Se uso il charset di default di apache utf8 mi stampa bene nelle pagine web i dati provenienti dai database ma ho dei problemi con le pagine statiche con alcuni caratteri tipo lettere accentate e simboli.
Se invece uso il charset ISO-8859-15 succede il viceversa, ovvero non ho più i problemi con le lettere scritte nel html ma ho problemi con alcuni caratteri presi dai db.
Cosa posso fare?
Quale charset devo tenere?

[side-server]

usa la codifica ISO-8859-1 dopodichè modifica eventuali errori delle lettere direttamente dal db così non dovresti più avere problemi.

[Teuzzo]

Con la codifica ISO-8859-1 mi vede bene tutti i caratteri delle pagine web statiche.
Però non mi vede bene alcuni caratteri nel db mysql.
Ci sono milioni di dati, come faccio a modificarli tutti?