ciao a tutti ho un codice

document.getElementById("nomi_duplicati").innerHTM L = str;

che mi va a sostituire il contenuto di un div (il contenuto viene preso dinamicamente lato server ... in questo contenuto includo anche delle funzioni javascipt).. il problema è che le funzioni javascript (un semplice alert ...) non funzionano .. come potrei risolvere ciò?
So che innerhtml non "gestisce" codice javascipt ....

Qualcuno ha qualche consiglio?
grazie