Problema con la StringTokenizer..

[Darèios89]

Devo leggere un file di input di questo tipo:

(1,3)
(4,5) 
(2,5)
(5,1)
(3,2)
(2,1)
(1,1)
(5,5)
(6,5)

Cioè dalla stringa io converto in intero i due numeri che compaiono per ogni riga scartando le parentesi e la virgola, ma mi vengono dati errori, come se si volesse convertire anche lo spazio, cioè " " che tra l'altro visto che non c'è non capisco dove lo trova...
Non capisco che cosa non vada...questo è il codice:

import java.io.*;
import java.util.*;

public class Main
{
	FileReader reader=null;
	StringTokenizer str;
	PrintWriter out=null;
	BufferedReader buff=null;
	
	public void Costruiscialbero(String input, String output)
	{
		try{
			reader=new FileReader(input);
			buff=new BufferedReader(reader);
			out=new PrintWriter(output);
			
			BSTree<TNode> albero=new BSTree<TNode>();
			
			while(buff.ready())
			{
				str=new StringTokenizer(buff.readLine(),"(,)");
				
				int primo=0;
				int secondo=0;
				
				while(str.hasMoreElements())
				{
					primo=(Integer.parseInt(str.nextToken()));
					secondo=(Integer.parseInt(str.nextToken()));
				}
				
				Coppia coppia=new Coppia(primo, secondo);
				TNode<Coppia> nodo=new TNode<Coppia>(coppia);
				
				albero.insert(nodo);
				
			}
		      }
			
			catch(FileNotFoundException e1)
			{
				System.out.println("Error...file not found");
			}
		
			catch(IOException e2)
			{
				System.out.println("Error...input/output");
			}
			
			finally{
				try{
					
					buff.close();
					reader.close();
					out.close();
				      }
				      
				      catch(IOException e3){
					      System.out.println("Error...it is not possible to close files");
				      }
			      }
	}
	
	public static void main(String [] args)
	{
		Main main=new Main();
		long start=System.currentTimeMillis();
		main.Costruiscialbero("input.txt", "output.txt");
		long end=System.currentTimeMillis();
		System.out.println("Il tempo d'esecuzione è "+(end-start)+" ns");
	}
}

E questi gli errori:

Exception in thread "main" java.lang.NumberFormatException: For input string: " "
	at java.lang.NumberFormatException.forInputString(Unknown Source)
	at java.lang.Integer.parseInt(Unknown Source)
	at java.lang.Integer.parseInt(Unknown Source)
	at Main.Costruiscialbero(Main.java:29)
	at Main.main(Main.java:69)