non entro nel merito di js perché sinceramente non me ne intendo molto, comunque in quel modo non ti passerà mai nessun valore, perché mescoli codice js a codice php e le variabili php giustamente non vengono lette. Prova così:
codice:
<script type="text/javascript">
<!--
var stile = "top=10, left=10, width=640, height=480, status=no, menubar=no, toolbar=no scrollbar=yes";
function Popup(apri) {
window.open("caratteristiche.php?edit=<? echo $row['Caratteristiche']; ?>&pop_title=<? echo $row['Denominazione']; ?>", apri, stile);
}
//-->
</script>