quanto conta avere anzichè
www.agenzia.com/index.php?id=123
avere
www.agenzia.com/viaggi/marocco/
a livello di indicizzazione per la parola "viaggi marocco" se il contenuto della pagina è uguale?

E soprattutto come posso trasformare tutto il sito secondo la seconda opzione?
C'è qualche linguaggio che devo imparare per trasformare le variabili e qualche guida da consultare online?

Grazie