Uscita anomala da ciclo while con tabella enorme

[Botola59]

Ciao a tutti, da giorni ho una tabella che è cresciuta in modo esponenziale.

Contiene 12.850.000 record ed è composta da un solo campo di tipo text.

Ho creato un ciclo while che effettua delle operazioni ad ogni record letto.

Il grave problema è che ad un certo punto ( ogni volta su record diversi quindi non si può impurate ad un record sporco o a specifiche anomalie del tracciato record) senza segnalare errori esce dal ciclo anticipatamente lasciando così a metà l'opera!

E' come se non ce la facesse con le risorse del server ad eseguire tutto il ciclo.

questo lo script:

$query_rst_schede = "SELECT * FROM appo_1_cartelle ";
$dati=mysqli_query($link1, $query_rst_schede, MYSQLI_USE_RESULT) or die("Errore Query - 1");

while($array=mysqli_fetch_array($dati))    {
        $carx_codut2  = addslashes(substr($array['campo'],3,2));
        $carx_cf = addslashes(substr($array['campo'],81,16));
        $carx_codprov = addslashes(substr($array['campo'],58,3));
        $carx_codcom = addslashes(substr($array['campo'],61,3));
        $carx_emisced = addslashes(substr($array['campo'],64,7));

        $query_rst_anagr = "
        SELECT anagrafica.ana_codut2, anagrafica.ana_cf, anagrafica.IDana
        FROM anagrafica
        WHERE anagrafica.ana_codut2 =  '$carx_codut2' 
        AND anagrafica.ana_cf = '$carx_cf'
         ";
        $dati_anagr=mysqli_query($link, $query_rst_anagr) or die("Errore Query - conc");
        $array_anagr=mysqli_fetch_assoc($dati_anagr);
        $IDana = $array_anagr['IDana'];
        mysqli_free_result($dati_anagr);
    
    
        $query_rst_carte = "
        SELECT cartelle.IDCart, cartelle.car_codprov, cartelle.car_codcom, cartelle.car_emisced
        FROM cartelle
        WHERE cartelle.car_codprov = '$carx_codprov'
        AND cartelle.car_codcom = '$carx_codcom' 
        AND cartelle.car_emisced = '$carx_emisced'
         ";
        $dati_carte=mysqli_query($link, $query_rst_carte) or die("Errore Query - carte");
        $array_carte=mysqli_fetch_assoc($dati_carte);
        $IDCart = $array_carte['IDCart'];
        mysqli_free_result($dati_carte);

        if($IDana){        
            if($IDCart){

                $query_rst_re1 = mysqli_query($link, "
                UPDATE cartelle 
                SET
                car_host = '1'
                WHERE cartelle.car_codprov = '$carx_codprov'
                AND cartelle.car_codcom = '$carx_codcom' 
                AND cartelle.car_emisced = '$carx_emisced'
                ") or die("Errore query UPDATE cartelle filtro ");

            }
        }    
    }
}
mysqli_free_result($dati); 

Ho usato MYSQLI_USE_RESULT perchè senza non riusciva a caricare la query.

Importante!!! Chiaramente è una procedura batch eseguita da linea di comando DOS.
- Testata su Windows Server 2003 e 2008 con MySql commerciale Enterprise e PHP 5.3.
- Tabella testata sia come MyIsam che Innodb.
- Le tabelle sono tutte indicizzate.
Tutto con lo stesso risultato anomalo.

Grazie anticipatamente. Attendo con ansia