Bash+Perl

[Giulia_De]

Ciao ,

ho uno script bash che semplicemente mi produce un file in output:

/biotools/analysis-interfaces/run/PatSearch -INPUT=$2 -COMMAND=$4 -OUTPUT=$2.out -NO_TEXT -NO_INFORMATION
cat $2.out

Mi è stato chiesto di elaborare in un certo modo il file in output prima di fare il cat.
Da qui l'idea di fare lo script Perl in allegato.
Ora voglio realizzare l'intero script in Perl ... inglobando anche
quanto avevo fatto nel bash.
Ma non ho idea da dove poter cominciare.
Grazie per l'aiuto


Giulia

[Mich_]

Per chiamre un file esterno, puoi usare la funzione system:
system (/biotools/analysis-interfaces/run/PatSearch -INPUT=$2 -COMMAND=$4 -OUTPUT=$2.out -NO_TEXT -NO_INFORMATION );

Per stampare a video, puoi usare la funzione print:
print "$variabile ciao ciao \n";

pero` per stampare un file, fai piu` presto ad usare il cat dentro il system