tuo stesso problema...
la soluzione per lightbox è richiamare nella pagina caricata dinamicamente:
<script type="text/javascript">
onmouseover="if(!window.albumInit){initLightbox(); window.albumInit=true;};"
</script>
e aggiungere al tag del link <a> il seguente comando:
onClick="myLightbox.start(this); return false;"
ora sto cercando di trovare una soluzione per shadowbox.... ma ancora nada