come già detto qualche post più su, non è quella la maniera di scrivere un file di Word. Non basta l'estensione a determinarne il tipo.

Qui

http://www.roseindia.net/tutorial/ja...reatoWord.html

trovi un esempio di come prendere del testo da una JTextArea e salvarlo in un file .doc. Usa come spunto quel metodo writeDoc

codice:
private static void writeDoc(String FileName, String content) {
                try {
                        POIFSFileSystem fs = new POIFSFileSystem();
                        DirectoryEntry directory = fs.getRoot();
                        directory.createDocument("WordDocument", new ByteArrayInputStream(
                                        content.getBytes()));
                        FileOutputStream out = new FileOutputStream(FileName);
                        fs.writeFilesystem(out);
                        out.close();
                } catch (Exception ex) {
                        System.out.println(ex.getMessage());
                }
        }