Ho risolto.

Ho inserito
String path = getServletContext().getRealPath("/");
File f = new File(path + "config.ini").

E ho messo il file config.ini direttamente nella cartella contenente le pagine web (in NetBeans è di default la cartella \web).

Ringrazio Mde2005, valia e leleft per l' aiuto e per la disponibilità, quando avete bisogno voi fate un fischio e spero di poter essere utile anch'io