Qualche suggerimento da implementare
leggi la riga con fgets()
hai una stringa che termina con il \n , dovresti sostituire il \n con \0 , trovi esempi in rete

ora hai una stringa di cifre separate da uno o più caratteri spazio , puoi usare strtok() per spezzare la stringa in sottostringhe composte dai "numeri" che vuoi


http://www.cplusplus.com/reference/cstring/strtok/