Oppure così, forse è meglio:

dentro il tag inframe metti

<iframe style="FILTER: chroma(color=#CC9966)" allowTransparency>

dove #CC9966 è il colore che vuoi trasparente all'interno del codice

BODY {
scrollbar-face-color:#CC9966;
scrollbar-arrow-color:#CC9966;
scrollbar-track-color:#CC9966;
scrollbar-shadow-color:#000000;
scrollbar-highlight-color:#000000;
scrollbar-3dlight-color:#CC9966;
scrollbar-darkshadow-color:#CC9966;

Un esempio lo vedi qui:
http://www.la-soldier.net/Graphics/Tutor/transscr.htm