allora, andiamo con ordine.
dalla app non ti connetti mai direttamente al db remoto.
ma ti connetti tramite web service.
quindi:
-dalla app fai una request al file remoto (scritto in qualsiasi linguaggio lato server, non necessariamente php)
-il file remoto elabora la request
-fa le operazioni su db
-restituisce una risposta
-dalla app leggi la risposta
questo, a grandi linee, vale sia che usi phonegap, che non.
per quanto riguarda il db locale da usare offline, qua la cosa si complica.
dovresti avere un db sqlite sul dispositivo da sincronizzare con i dati remoti.
dico sqlite perchè è la cosa più "standard" se vuoi sviluppare sia su android che su ios.
sia usando phonegap e simili, sia se vuoi usare codice nativo.
per quanto riguarda produrre l'app, dipende su che piattaforma:
-per apple ti serve un mac e xcode, e poi seguire il tutorial ufficiale
-per android, ti conviene usare android studio, e poi sempre seguire i tutorial
però penso sia l'ultimo dei tuoi problemi al momento.

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