Assodato che la versione da usare è la 3.5 , ti consiglio di leggere il file readme contenuto nel .zip che hai scaricato....
io personalmente avevo la necessità contraria alla tua, cioè a me il fullscreen non serve quindi ho risolto con il nuovo player e quella sola variabile impostata su false
Nel tuo caso ti consiglio dare un valore e tutte le variabili inerenti al fullscreen...(fullscreenpage, fsreturnpage, fullscreenmode, showfsbutton) secondo me è quello il tuo problema, leggiti il readme e fai qualche prova!
e poi di consiglio di vedere come inserimento, come ha fatto jeroen wijering sul suo sito
codice:
<script type="text/javascript">
//<![CDATA[
var FO = { movie:"upload/flvplayer.swf",width:"600", allowfullscreen:"true",height:"250",majorversion:"7",build:"0",flashvars:"height=210&width=300&displayheight=190&lightcolor=0x335500&fullscreenpage=/embed/fullscreen.html&fsreturnpage=/%3Fitem%3DFlash_Video_Player&file=http://blip.tv/%3F1%3D1%26s%3Dposts%26skin%3Drss" };
UFO.create(FO,"banner");
//]]>
</script>
A presto