Beh è una bella mole di programmi non v'è dubbio.
Non posso nemmeno immaginare la quantità di librerie e file vari sparsi in lungo ed in largo nelle directory di sistema...
Onestamente a distanza è difficile farsi un idea precisa della strada dai intraprendere: se il sistema ora come ora non presenta problematiche particolari ed è sufficiemente reattivo, forse è il caso di.....non toccare nulla.