prima di operare sui files nascosti, dovresti eseguire sui pc delle scansioni con Bitdefender e postare i risultati.
Ad uno dei tre pc, poi, devi collegare anche la pen, così verifichi sia effettivamente tutto ok.

riguardo le modifiche che non reggono, poi, potremmo provare ad importarle direttamente dal registro (in alcuni casi così facendo funziona).

dovresti anche indicarmi quali valori impostati hai (ossia quali trovi modificati)

detto questo, apri una nuova discussione e posta le info richieste

ciao