Non comprendi quanto scrivo perchè siamo a due livelli di conoscenza molto diversi.
Ovviamente io sono al livello basso... molto basso...
Ho capito bene?
Una pagina es. form.php con l'Action che esegue la pagina controllo.php che fa tutte le verifiche del caso sul file inviato e se tutto ok fa l'upload e poi lancia un programma PERL.

Se così fosse le variabili da controllo.php al Programma Perl non le perdo?

Grazie.