inserisci tutti i contenuti della tua colonna di destra dentro un div, al quale dai un'altezza precisa e per il quale imposti la proprietà overflow:scroll;

in questo modo:

<table>
<tr>
<td>
<table>
<tr>
<td>
contenuti colonna sinistra
</td>
</tr>
</table>
</td>
<td>
<div style="height: 250px; overflow: scroll;">
contenuti colonna destra, per l'altezza metti quella dei tuoi contenuti sulla sinistra
</div>
</td>
</tr>
</table>

così dovrebbe funzionare...