Tu penso sai che su uno linka la home del dominio mettiamo

www.nomedominio.com

con per esempio

www.nomedomino.com/index.html

in realtà disperde il pr perchè il bot crawler del motore lo interpreta come fossero due pagine distinte.

Pertanto avrai magari pr4 per

www.nomedominio.com

e pr1 o 2 per

www.nomedomino.com/index.html

Ok?

E così anche altre combinazioni, mi sembra addirittura anche per

www.nomedominio.com rispetto a

nomedominio.com
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E così via.
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Lo stesso potrebbe accadere nel caso tu linki le pagine interne non in modo assoluto

http://www.nomedomino/paginainterna.html

ma semplicemente :

paginainterna.html
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Potrebbe quindi accadere di avere per la stessa pagina due pr distinti e diversi:

uno per

http://www.nomedomino/paginainterna.html mettiamo per esempio PR3

ed uno

paginainterna.html mettiamo per esempio PR1.
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Risultato?
Hai disperso del PR o meglio non lo hai raggruppato su una unica entità.
Dato appunto che il motore distingue l'entità assoluta e l'entità relativa.
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Dovrebbe essere così e spero che qualcuno confermi o smentisca....
...magari spiegando.