2 siti "completamenti uguali" a prescindere dall'avere lo stesso IP o meno sono destinati al gioco della torre... "Chi butto giù?" si chiede Google o chi per esso.
Puoi accorpare il contenuto dei 2 siti in un unico sito (ma se i contenuti sono "identici" non avrebbe senso), puoi avere 2 siti sullo stesso dominio giocando su secondo/terzo livello (idem come sopra), puoi mantenere i 2 domini differenziando però i contenuti dei 2 siti.
Penso quest'ultima soluzione sia la migliore. Sentiamo cosa ne pensano gli altri.