Credo di aver capito qual'è la filosofia di questi plugin, però a questo punto penso che una volta che l'IDE riesce a gestire Jboss non ci siano altri problemi, o si deve aggiungere qualcosa anceh all'application server per lavorare con gli EJB, nel senso i file jar aggiuntivi vanno messi solo nella cartella delle nostre applicazioni e basta