Sei abituato a lavorare con Access dovrai un po fare pratica su un' ambiente scarno di grafica e di cose gia fatte che sono assenti in MySQL.
Però se fai delle query la sintassi è la stessa e dopo un breve periodo di adeguamento per capire un po come funziona MySQL e la sua interfaccia browser PhpMyAdmin non avrai problemi.
Php e MySQL sono molto piu performanti in quanto MySQLoccupa molto meno spazio su disco ed è ottimizzato alla grande per gestire enormi quantità di dati mentre Access no. Certo, per una tabella sola la gran performance non ti serve a molto però potresti considerla come un investimento per il futuro: magari ti capita un sito complesso.. con Access avresti dei rallentamenti che non hai con MySQL