Hai perso tutto l'hive del registro inerente la chiave HKEY_LOCAL_MACHINE; in buona sostanza se neanche il CD di Windows riesce a sistemare la faccenda devi reinstallare tutto.
P.S.: consiglio di esperienza: prova a staccare/riattaccare il cavo IDE che collega il disco fisso alla scheda madre e a vedere che tutti i cavi siano saldi, alle volte il problema è quello; alla peggio non serve a niente .