Credo che la funzione che tu stai cercando sia NATSORT().

Ho trovato un po' di documentazione in it.php.net, ma se devo essere onesto non sono riuscito a farla funzionare esattamente come intendevo io.

Questa funzione ordina in modo naturale degli elementi in base ai nomi.

Per capirci.
Se ordinassi in modo naturale una lista (che ne so) di file nominati 1.jpg 2, jpg ..... 11.jpg, la lista sarebbe ordinata così:
1.jpg
11.jpg
2.jpg
ecc

Con NATSORT invece otterresti la lista del tipo 1, 2, 3 [...] 10 ecc