Ricapitolando...
1. Ho rinominato il file JS in php
ed ha questo formato:
//COSTANT
var homePage = "utenti/<?php echo $_SESSION['username']; ?>";

//VARS
var listfile;
var sortfile;
...

2. Ho incluso il nuovo file .php

Ma se testo non mi viene interpretato il percorso. Per prova ho stampato a video nella pagina madre php la variabile di sessione e funziona.

Dunque dove potrei sbagliare? Si può capire se il file contenente il js viene interpretato?