Cerco di riassumere, interpretare e dare una schematizzazione al problema, dato che non lo ho capito bene.

Tu vuoi salvare una pagina, con tutti i file associati, in modo da poterla rivedere off-line senza problemi.
Se cio` e` corretto, il quesito e` off-topic per questa sezione.

Per avere una risposta devi anche dire che browser stai usando: io con FF 1.5 non ho mai avuto problemi in tal senso: viene salvata la pagina (con estensione .html), ed in piu` un file con lo stesso nome ed il suffisso _files che contiene tutti i file associati (CSS e JS).
Il problema e` semmai come risparmiare spazio, quando i CSS sono comuni a piu` pagine (il browser non e` cosi` intelligente da vedere che sono gli stessi file appena salvati per un'altra pagina).