Io ti posso dire una cosa... su esperienza di decine di siti, milioni di utenti e migliaia di conversioni. Phpstats secondo me .. nonostante tutti i suoi limiti non sbaglia mai.

Ovvero mi è capitato più volte... vista una strana richiesta di info derivanti da un sito di andare ad analizzare quella visita su phpstats (referrer, accesso ecc ecc) e l'ho sempre trovato, il che mi fa pensare che Php stats conti comunque tutti.

E se vai in dettagli visitatori ti rendi conto abbastanza bene dei percorsi, quindi non sbaglia.

Su altri sistemi di statistica anche io ho trovato scostamenti ... (stesse google analytics) ... io credo a phpstats...
Purtroppo ha numerosissimi limiti (a me piace molto per determinate funzioni utilissime anche shinystat business) ma ho un problema di riservatezza e condivisione dei dati (non voglio far vedere a loro determinate statistiche)