Premetto che non ho ancora guardato a fondo junit4.1, comunque dall'articolo presente sul sito si vede che per far partire i test direttamente da netbeans bisogna aggiungere ad ogni classe di test un metodo statico fatto in questo modo:

Codice PHP:
public static junit.framework.Test suite() { 
    return new JUnit4TestAdapter(Example.class); 
} 
L'unica nota è che con junit4.1 mi sembra che non si possa più specificare un nome particolare per i Test, e quindi in netbeans vengono chiamati tutti unknown