Sono sempre 4 x 3 le tabelle?
Devi usare x forza un arrary bidimensionale?
altrimenti nn sarebbe difficile con l indice che indica le coordinate :

$table = array();
$table[11]= "A1";
$table[12] = "B1";
$table[13] = "C1";
$table[14] = "D1";

$table[21] = "A2";
$table[22] = "B2";
$table[23] = "C2";
$table[24] = "D2";

$table[31] = "A3";
$table[32] = "B3";
$table[33] = "C3";
$table[34] = "D3";