Rinomina lo script da js a php. Poi lo includi così:
<script type="text/javascript" src="myScript.php?path=<?php print($path); ?>"></script>
Poi nello script puoi assegnare a una variabile js una variabile php
pathJS=<?php print($_GET['path']); ?>;
C'è però un effetto collaterale... Lo script verrà ricaricato ogni volta; per evitare ciò crea un altro file esterno dove setti solo la variabile.