Chiaramente con quei numeri ti conviene fare una routine specifica, e magari prepararti in anticipo il vettore con tutti gli oggetti cui applicare la cosa, in modo da ridurre i tempi al click.Pero` puoi fare un loop su tutti gli oggetti che hanno una certa classe oppure che hanno l'id che inizia in un certo modo
Se sono mille, probabilmente vedi che il browser si ferma un attimo per elaborare il tutto. Potrebbe impiegarci da un secondo a una decina (dipende dalla potenza del client).
Dato che sta diventando un problema di loop JS, sposto nel forum javascript.