Codice PHP:
// I numeri in cui è compreso il numero random
$num_da 0;
$num_a  9999;

// array dei numeri da escludere, puoi mettere tutti quelli che ti servono
$numeri_da_escludere = array(60,200,3000);

$numero_random rand($num_da,$num_a);

// creiamo un ciclo infinito dove si esce solo se il numero random creato
// non appartiene ai numeri da escludere
while(1)
{
   if(!
in_array($numero_random,$numeri_da_escludere))
   {
      break;
   }

Non l'ho testato, spero che esca davvero dal ciclo
Prova e fammi sapere.
ciao