questo dovrebbe bastare

codice:
function isEmptyDir($dir) {
if(count(array_merge(glob($dir.'*'), glob($dir.'.*')) <= 2) {
  return true;
} else {
  return false;
}

$dir = "percorso/alla/dir/"; // occhio a nn dimenticare lo slash finale.

if(isEmptyDir($dir)) {
  echo "La dir è vuota";
} else {
  echo "La dir non è vuota";
}
ciao