Se non fai fesserie non ti formatta la partizione di linux , l'unica cosa è che perderai l'MBR e di conseguenza il grub , quindi ti consiglio di crearti un floppy con su il grub per far ripartire ubuntu poi una volta partita reinstalli in grub sull'hd . Oppure se non vuoi fare il floppy perchè non c'è l'hai puoi reinstallare il grub dopo con la live di ubuntu .