Ciao
Premesso che NON conosco Coppermine, a sensazione penso che:
- Quando ti sei registrato come utente normale il limite era a 1024, quindi questo valore di default è stato salvato nel record dell'Utente.
- Hai aumentato il limite di default, ma se, come penso, il limite è stato salvato sul record dell'Utente, questo nuovo limite sarà valido solo per i nuovi Utenti da ora in poi.
- Mi gioco un centesimo che se provi a registrarti come nuovo Utente avrai il limite a 20000!

Chissà se ci ho preso!

EDIT:
Ci ho (quasi) preso!
Ho scaricato Coppermine ed ho guardato alle strutture del DB MySql.
Ebbene, all'atto della installazione viene creato un GRUPPO UTENTI con nome 'Registered', al quale viene assegnata una 'quota' di 1024 KB.
Mi fermo qua, a te l'analisi per vedere se si può, nell'eventuale gestione gruppi di Coppermine, cambiare la quota!

RI-EDIT:
Vai nel pannello di controllo dei Gruppi, là troverai il famigerato 1024 !!

HTH
Zappa