bè, puoi scambiare dati tra le applicazioni, magari memorizzando le informazioni nella clipboard...
di piu non so dirti...
ES:
1) Fai partire l'applicazione che hai fatto con un shell e fai partire un timer che controlla la clipboard.
2) Controlla con il timer avviato quando nella clipboard cè un messaggio che indica la chiusura del programma avviato mentre controlli il tempo impiegato dal programma.
3 Ovviamente l'altro programma deve avere del codice per dire a che punto si trova...
Ciao!