Di solito quando devo fare una cosa del genere preparo uno stage che ha le stesse dimensioni di quello del filmato principale. Poi usando i righelli prendo la misura precisa di dove devo piazzare il nuovo filmato e così posiziono correttamente nel filmato secondario l'animazione, e infine dal filmato principale lo richiamo attraverso

loadMovieNum("PathFilmato", x)
dove x indica a quale livello visualizzarlo ad esempio 1 che il primo livello subito sopra il filmato principale.

In questo modo dovresti riuscire a fare tutto tranquillamente.