e' evidente che se fai il backup includi tutto, ma normalmente i backup si fanno su una partizione separata del disco principale, o su un altro disco anche esterno, e di solito si crea anche un floppy di ripristino che permette di avviare il sistema e di ripristinarlo utilizzando il backup effettuato.

Ma piuttosto che il backup di Windows in molti casi è meglio utilizzare dei software che generano un'immagine del disco come Norton Ghost o Drive Image, e che consentono di ripristinare una macchina in pochi minuti.