"Robot Rage" e "On The Run" non sono stati realizzati con Flash, ma con Director, così come la maggior parte dei giochi che si trovano nel primo link

E' possibile creare giochi 3d con Flash, ma è più scomodo e complesso di quanto sia possibile fare in Director, poichè quest'ultimo offre una gestione dei modelli 3D che Flash non ha.
Recentemente per Flash sono nati dei motori di rendering 3d come Sandy (di cui trovi una guida su flash.html.it) e Papervision, ma Director è comunque probabilmente più adatto, anche se poi il player shockwave si rivela piuttosto pesante (e questo è dovuto in parte proprio alla possibilità di gestire il rendering 3D) rispetto al flash player e questo ne ha limitato la diffusione.