Ma anche in un altro forum ti direi che non ho capito nulla del tuo problema ...
Che vuol dire "un disco senza sistema operativo" ?
Se il sistema e' in C e hai un altro disco D (con dei dati), il programma puo' essere posto in D ma ovviamente il computer sta funzionando perche' ha caricato il sistema da C ...
Insomma ... che vuoi dire?