avendo un tema di immagini che varia a seconda del colore, io personalmente ho creato una cartella principale di immagini comuni e varie sottocartelle con le immagini specifiche del tema ed il css che viene caricato dal codice a seconda delle preferenze dell'utente.
Ho creato il primo css, e poi ne ho modificato i due o tre colori necessari.
Magari non è la scelta migliore sotto il profilo della programmazione, però in questo modo ho tutti i temi separati ed ordinati e un css dedicato ad ognuno che posso visionare al volo con l'applicazione che uso per editarli.