Ho capito cosa intendi, vorresti che tramite PHP richiami una funzione javascript quando stampi, cetto devi fare attenzione dove inserisci lo script php, prova magari all'inizio con un
Codice PHP:
echo '<script type="text/javascript">alert("Test javascript");</script>'; 
Sarebbe l'ideale se faresti comparire questo all'interno di <head></head>