Si può includere un file .js in un altro file .js?
No anche perche non avrebbe senso, pero puoi richiamare/includere nella pagina tutti i file.js che vuoi.

codice:
<head>
<script language="javascript" type="text/javascript" src="main.js"></script>
<script language="javascript" type="text/javascript" src="libreria1.js"></script>
<script language="javascript" type="text/javascript" src="libreria2.js"></script>
</head>