se hai un kernel gia compilato basta rimuovere il link /usr/src/linux e fare il link linux al nuovo kernel che vuoi ricompilare rm linux poi
ln -s linux-2.6.21-rc6 linux se hai scompattato il kernel linux-2.6.21-rc6 ad esempio
il vecchio kernel non lo devi rimuovere fino a quando non sei sicuro che il nuovo va

ricompilando semplicemente
make menuconfig
make
make modules_install
make install

riprende esattamente le impostazioni precedenti

carica la configurazione /boot/config



mrproper si usava con il kernel 2.4 principalmente