aggiungo al "non avrebbe senso":

1) eviti di dichiarare nell'html una quantità spropositata di link nel caso tu voglia usare diverse librerie.
2) occulti alla semplice vista del solo codice html le altre inclusioni (essendo queste scritte dinamicamente dallo script)

ovviamente basterebbe aprire il main.js per trovare il link agli altri file, ma quello che mi importa è avere una pagina html quanto più pulita possibile.

"non avrebbe senso" per te. Per me ne ha e come!