vanno abilitate nel file di configurazione, ma sinceramente nella tua versione, veramente obsoleta, non ci proverei nemmeno a farlo. Dipende anche dalle risorse disponibili del server, ma se c'e' la ver. 3 mi sa che pure quello lascia il tempo che trova.

Se e' solo per le foreign key puoi fare dei controlli con lo script che ne suppliscono in pieno la funzione. Tra la versione 3 e la 5.0 di mysql c'e' un universo di mezzo.