allora hai due possibilità.... se i due server sql si vedono in rete non devi fare altro che esportare i dati direttamente click destro db tutte le attività esporta dati e da li fai tutto
Se i due non si vedono crei inizialmente lo script per creare database e strutture e poi usi un tools (fornito di serie con sql server) che si chiama bcp, funziona da linea di comando, guarda l'help per i dettagli

Matteo