In pratica io credo che questo oggetto venga cercato nella finestra popup, ed ovvio che non lo trova!!...come se la funzione richiamata all'onclick, il sistema voglia farla eseguire nella finestra popup...
Io invece dovrei dirgli qualcosa tipo:
1. seleziona il progetto nel menu a tendina
2. esegui la funzione MA NELLA PAGINA MADRE
3. chiudi finestra pop up